Cơ khí là một trong những lĩnh vực được tổ chức đào tạo ngay từ những ngày đầu thành lập Trường Thủy sản – tiền thân của Trường Đại học Nha Trang ngày nay. Trải qua hơn 65 năm hình thành và phát triển, quy mô và phạm vi đào tạo của Khoa Cơ khí không ngừng được mở rộng, từng bước đáp ứng yêu cầu ngày càng cao và đa dạng của xã hội. Tiền thân của khoa Cơ khí hiện nay là Bộ môn Cơ khí tàu thuyền được tách ra từ bộ môn Khai thác thuộc khoa Thủy sản của Trường Đại học Nông Lâm (Hà Nội). Lớp Cơ khí đầu tiên gồm 14 sinh viên được tách ra từ lớp Khai thác thủy sản khóa 3 vào năm 1966 với mục tiêu đào tạo kỹ sư làm việc trong lĩnh vực sửa chữa, đóng mới và quản lí kỹ thuật tàu thuyền thủy sản.

Mặc dù trải qua nhiều khó khăn, thử thách, sự nghiệp đào tạo ngành Cơ khí chưa bao giờ bị gián đoạn, kể cả trong những năm tháng chiến tranh ác liệt. Qua nhiều thế hệ, cán bộ và sinh viên Cơ khí đã không ngừng trưởng thành, đảm nhiệm nhiều vị trí quan trọng trong các cơ quan quản lý nhà nước, cơ sở sản xuất – kinh doanh, đào tạo và nghiên cứu khoa học, góp phần tạo nên những dấu ấn đáng tự hào trong quá trình phát triển của ngành Cơ khí và của Trường Đại học Nha Trang. Tiêu biểu có thể kể đến Thầy Nguyễn Trọng Nhuận, TS. Phan Lương Tâm, PGS.TS. Quách Đình Liên, PGS.TS. Nguyễn Văn Ba, PGS.TS. Dương Đình Đối, PGS.TS. Nguyễn Quang Minh, PGS.TS. Nguyễn Hữu Dũng và nhiều thế hệ cán bộ, cựu sinh viên khác; trong đó có các đồng chí từng giữ cương vị lãnh đạo ngành thủy sản tại các địa phương như Phạm Ngọc Anh, Đào Văn Bảo, Phạm Hữu Thế, Võ Thiên Lăng,... Song song với nhiệm vụ đào tạo, hoạt động nghiên cứu khoa học của ngành Cơ khí được duy trì và phát triển qua nhiều thời kỳ, với nhiều đề tài có tính sáng tạo, thực tiễn và khả năng ứng dụng cao. Những kết quả này không chỉ góp phần giải quyết các vấn đề kỹ thuật trong sản xuất mà còn thể hiện tinh thần tiên phong, năng động và sáng tạo của các thế hệ thầy và trò Khoa Cơ khí.

Nhờ sự lớn mạnh của Khoa Cơ khí và để đáp ứng sự phát triển đa ngành và nhu cầu của xã hội, Khoa Cơ khí được tách ra thành Khoa Cơ khí và Khoa Kỹ thuật tàu thủy vào năm 2007. Năm 2011, Nhà trường tiếp tục tái cơ cấu các Khoa và Bộ môn cho phù hợp với tình hình mới. Khoa Kỹ thuật tàu thủy được đổi tên thành Khoa Kỹ thuật giao thông. Bộ môn Kỹ thuật Ô-tô được chuyển từ Khoa cơ khí sang Khoa Kỹ thuật Giao thông. BM Kỹ thuật Xây dựng  và Cơ học - Vật liệu được tách ra thành Khoa Kỹ thuật xây dựng. BM Nhiệt lạnh của Khoa Công nghệ thực phẩm được chuyển về Khoa Cơ khí. Năm 2013 Khoa Cơ khí mở thêm chuyên ngành đào tạo chuyên ngành kỹ thuật Cơ khí do bộ môn Chế tạo máy phụ trách.

Năm 2026, thực hiện chủ trương sắp xếp và kiện toàn cơ cấu tổ chức, Trường Kỹ thuật & Công nghệ được thành lập trên cơ sở tổ chức lại các đơn vị thuộc khối kỹ thuật, trong đó có Khoa Cơ khí. Theo cơ cấu tổ chức mới, Khoa Cơ khí được tái cơ cấu, đồng thời tách thành hai đơn vị gồm Khoa Cơ khí và Khoa Kỹ thuật Năng lượng (tiền thân là Bộ môn Kỹ thuật Nhiệt lạnh).

Cùng với quá trình tái cơ cấu tổ chức, các Bộ môn thuộc Khoa cũng được giải thể và chức năng quản lý, tổ chức đào tạo được chuyển giao cho các Ban Chủ nhiệm Chương trình đào tạo. Mô hình này nhằm tinh gọn bộ máy, tăng tính chủ động trong quản lý chương trình đào tạo và nâng cao hiệu quả tổ chức các hoạt động đào tạo, nghiên cứu khoa học.

Theo cơ cấu tổ chức và định hướng đào tạo mới, từ năm 2026, Khoa Cơ khí tổ chức đào tạo 03 ngành chính, với các chuyên ngành/chương trình đào tạo cụ thể như sau:

1) Ngành Kỹ thuật Cơ khí

- Kỹ thuật Cơ khí

- Cơ khí Thủy sản thông minh – Minh Phú (CTĐT đặt hàng từ doanh nghiệp)
- Thiết kế và Chế tạo số

2) Ngành Công nghệ Chế tạo máy

3) Ngành Kỹ thuật Cơ điện tử

- Kỹ thuật Cơ điện tử
- Hệ thống Nhúng và IoT

Từ năm 2020, Khoa Cơ khí bắt đầu tổ chức đào tạo trình độ Tiến sĩ ngành Kỹ thuật cơ khí, bên cạnh chương trình đào tạo trình độ Thạc sĩ Kỹ thuật cơ khí đã được triển khai từ trước. Qua đó, Khoa từng bước hoàn thiện hệ thống đào tạo ở các trình độ đại học và sau đại học, góp phần nâng cao chất lượng nguồn nhân lực và phát triển hoạt động nghiên cứu khoa học trong lĩnh vực cơ khí ở khu vực Nam Trung bộ nói riêng và cả nước nói chung.

Đội ngũ cán bộ cơ hữu của Khoa Cơ khí hiện tại gồm 19 người, trong đó 4 PGS.TS, 7 TS. Được đào tạo tại Nga, Cộng hòa Séc, Hàn Quốc, Đài Loan, Nhật Bản,...; 3 nghiên cứu sinh trong và ngoài nước; toàn bộ cán bộ giảng dạy có trình độ từ thạc sĩ trở lên.

Thực hiện chủ trương đổi mới của nhà nước trong lĩnh vực giáo dục, ngành cơ khí nói riêng, trường Đại Học Nha Trang nói chung đã chủ động hợp tác với nhiều tổ chức quốc tế, trường viện thế giới như; Nhật Bản, Hàn Quốc, Thái Lan, Trung Quốc, cộng hòa Liên Bang Nga, Na Uy, Cộng Hòa Séc vv.., nhằm mục tiêu trao đổi sinh viên, giảng viên, trao đổi nghiên cứu học thuật, tiếp thu công nghệ đào tạo tiên tiến của các nước phát triển, tạo điều kiện cho sinh viên, giảng viên, các nhà nghiên cứu của trường trao đổi kinh nghiệm và nâng cao chất năng lực giảng dạy, nghiên cứu của mình.

Khoa Cơ khí nói riêng và Trường Đại học Nha Trang nói chung có hơn 65 năm kinh nghiệm trong đào tạo và nghiên cứu khoa học, gắn liền với sự phát triển của ngành thủy sản và các lĩnh vực kinh tế – xã hội. Trong quá trình phát triển, Khoa Cơ khí không ngừng đổi mới đào tạo, nghiên cứu và chuyển giao công nghệ, hướng đến cơ khí hóa, tự động hóa và phát triển các giải pháp công nghệ phục vụ ngành thủy sản. Đặc biệt, Khoa chú trọng nghiên cứu và đào tạo theo hướng nâng cao hiệu quả sản xuất, sử dụng tiết kiệm tài nguyên, giảm tác động môi trường và hỗ trợ phát triển bền vững ngành thủy sản. Qua đó, Khoa từng bước khẳng định vai trò là đơn vị đào tạo nguồn nhân lực kỹ thuật chất lượng cao và là đơn vị nghiên cứu, chuyển giao khoa học – công nghệ phục vụ phát triển thủy sản bền vững tại khu vực Nam Trung Bộ – Tây Nguyên.

Các mốc lịch sử quan trọng của Khoa Cơ khí:

Chân dung các Lãnh đạo Khoa

TT	Chân dung	Trưởng Khoa	Giai đoạn
1		Thầy Nguyễn Mậu Khai	1978-1988
2		PGS.TS Dương Đình Đối	1988-1990
3		PGS.TS Quách Đình Liên	1991-1995
4		PGS.TS Nguyễn Văn Ba	1995-2006
5		PGS.TS Nguyễn Văn Nhận	2006-2013
6		PGS.TS Nguyễn Văn Tường	2013 - 2023
7		TS. Nguyễn Hữu Nghĩa  Phụ trách khoa	2023 - 11/2024
8		PGS.TS Trần Hưng Trà	12/2024 đến nay